Ocena dotychczasowej realizacji Programu Operacyjnego Innowacyjna Gospodarka 2007 – 2013 wskazała na konieczność dokonania zmian w systemie wdrażania. Skierowany do zaopiniowania przez Zespół ds. Infrastruktury, Rozwoju Lokalnego, Polityki Regionalnej oraz Środowiska projekt rozporządzenia Ministra Rozwoju Regionalnego zmieniającego rozporządzenie w sprawie udzielania przez Polską Agencję Rozwoju Przedsiębiorczości pomocy finansowej na wspieranie tworzenia i rozwoju gospodarki elektronicznej w ramach Programu Operacyjnego Innowacyjna Gospodarka 2007 – 2013 przynosi kilka rozwiązań korzystnych dla przedsiębiorców.
Najistotniejsza zmiana dotyczy umożliwienia udzielania wsparcia mikroprzedsiębiorcom lub małym przedsiębiorcom funkcjonującym na rynku do 2 lat, licząc od momentu uzyskania wpisu do EDG lub KRS. Obecna granica 1 roku przy ukształtowanej praktyce organizowania konkursu jeden raz w roku sprawiała, że część przedsiębiorców, których nie wystąpiło w pierwszym konkursie (gdyż np. termin aplikacji upływał tuż po zarejestrowaniu działalności gospodarczej), traciło prawo do wnioskowania o wsparcie w kolejnym roku, z uwagi na przekroczenie rocznego okresu działalności.
Ze względów porządkowych wprowadzono przepis umożliwiający dofinansowanie projektów realizowanych przez mikroprzedsiębiorców lub małych przedsiębiorców zarejestrowanych w CEIDG. Zapewni to równość szans przy ubieganiu się o środki europejskie niezależnie od typu rejestru, w którym została zarejestrowana działalność gospodarcza.
Z innych zmian warto wymienić w szczególności: uproszczenie definicji elektronicznego biznesu typu B2B w celu ułatwienia przygotowywania projektów do wsparcia, uproszczenie przepisu określającego merytoryczny zakres realizowanych projektów w celu umożliwienia wsparcia bardziej zróżnicowanych działań oraz zniesienie przepisów regulujących ryczałtowy sposób rozliczania kosztów ogólnych.