Sudan Południowy jako niepodległe państwo powstał zaledwie cztery lata temu (niepodległość została proklamowana 9 lipca 2011 roku). Już jednak trzy lata wcześniej, pozostając częścią Sudanu, wdrożył własny system rejestracji pojazdów. System ten został utrzymany po uzyskaniu niepodległości.

Standardowe numery rejestracyjne składają się z liter „SS” (od Southern Sudan), kodu literowego miejsca rejestracji, trzech cyfr o charakterze porządkowym i litery o takim samym znaczeniu. Sudan Południowy podzielony jest na dziesięć stanów – kody literowe są ustalone w tej właśnie strukturze. Numer rejestracyjny napisany jest czarnymi znakami na białym tle. Z prawej strony tablicy rejestracyjnej widnieje flaga Sudanu Południowego. Przedstawia ona trzy poziome pasy rozdzielone wąskimi paskami – kolejno od góry: czarny, bordowy i zielony. Z lewej strony widnieje niebieski trójkąt z pięcioramienną gwiazdą.

Pojazdy rządowe maja numer rejestracyjny, w którym pierwsza grupa znaków to GOSS (Government of Southern Sudan).

Swój własny system rejestracji pojazdów ma armia (system ten pokrywa się z oznaczeniami pojazdów stosowanymi przez Ludową Armię Wyzwolenia Sudanu). Bardzo rozbudowany jest tez system oznakowania pojazdów należących do Organizacji Narodów Zjednoczonych.