Największą inwestycją realizowaną obecnie w ramach PO IŚ jest przedsięwzięcie podjęte przez Miejskie Przedsiębiorstwo Wodociągów i Kanalizacji w m.st. Warszawie S.A pn. Zaopatrzenie w wodę i oczyszczanie ścieków w Warszawie - faza IV. Całkowity koszt projektu wyniesie 594 mln euro, przedsięwzięcie zostało podzielone na 4 etapy. W ramach fazy I i faza II przeprowadzono modernizację infrastruktury wodociągowo-kanalizacyjnej Warszawy oraz poprawiono jakość i dystrybucję wody. Koszt modernizacji wyniósł 189 mln euro, z czego dofinansowanie z Funduszu Spójności wynosiło 62% kosztów kwalifikowalnych, tj. ponad 110 mln euro. Przedsięwzięcia podjęte w fazie III kosztowały ponad 405 mln euro, z czego wsparcie unijne wynosiło 248 mln. Realizowana obecnie faza IV ma na celu doprowadzenie wszystkich ścieków powstających na terenie aglomeracji warszawskiej do oczyszczalni ścieków i umożliwienie ich oczyszczania zgodnie z wymogami prawa. Obejmuje rozbudowę Oczyszczalni Ścieków „Czajka” oraz rozbudowę sieci kanalizacyjnej wraz z modernizacją wybranych obiektów. Całkowity koszt wynosi ponad 2,2 mld zł, zaś wsparcie unijne 691 milionów zł.
Dzięki tej inwestycji powstały nowe obiekty i systemy uzdatniania wody, oczyszczalnia ścieków, kilometry nowej sieci wodociągowej i kanalizacyjnej, unowocześniono także wiele odcinków już istniejącej. Na uwagę zasługuje wykorzystanie najnowszych systemów IT do zarządzania siecią wodociągowo-kanalizacyjną. W MPWiK wdrożono innowacyjny system informatyczny, który pozwala za sprawne i efektywne zarządzanie m.in. umożliwia zarządzanie układem dystrybucji wody, planowanie remontów sieci w sposób najmniej uciążliwy dla mieszkańców oraz przewidywanie pracy systemu kanalizacyjnego podczas intensywnych opadów.
Aquanet S.A. to największa w Wielkopolsce firma zajmująca się uzdatnianiem i dostarczaniem wody oraz odbiorem i oczyszczaniem ścieków. Aktualnie realizuje projekt „Uporządkowanie gospodarki wodno-ściekowej dla ochrony zasobów wodnych w Poznaniu i okolicach - etap I” finansowany ze środków Funduszu Spójności Unii Europejskiej, przyznawanych w ramach Programu Operacyjnego Infrastruktura i Środowisko. Całkowita wartość planowanych inwestycji wynosi ponad 726,4 milionów zł, zaś dofinansowanie z Unii Europejskiej to prawie 318 milionów zł. Projekt obejmuje 12 zdań inwestycyjnych, które będą przeprowadzone do 2015 na trenach Miast i Gmin: Poznań, Mosina, Luboń i Kórnik. Prace trwają już od 2007 roku, jako że projekt realizowany jest w ramach perspektywy 2007 - 2013, co umożliwia uzyskanie dofinansowania dla zadań już zrealizowanych. W związku z powyższym wydatki poniesione już od 1 stycznia 2007 kwalifikują się do refundacji ze środków Funduszu Spójności. Starania o uzyskanie dofinansowania trwały od grudnia 2004 roku. Przedsięwzięcie nie jest pierwszym wspólnym działaniem spółki Aquanet i Miasta Poznania. W latach 2005-2010 Aquanet przeprowadził inwestycje wodociągowo-kanalizacyjne w ramach projektu "Oczyszczanie ścieków i dostawa wody dla miasta Poznania" współfinansowanego z Funduszu Spójności. Całkowity budżet wyniósł 114 mln euro, czego dofinansowanie to prawie 60 milionów euro. Udało się rozbudować system kanalizacji sanitarnej dla miasta Poznania i gminy Tarnowo Podgórne, jak również zmodernizować Centralną i Lewobrzeżną Oczyszczalnię Ścieków.
Inwestycje podejmowane przez samorządy pozwalają na wydajniejszą i zgodną z wymogami polskiego oraz unijnego prawodawstwa eksploatację obiektów wodociągowo-kanalizacyjnych. Przyczyniają się do poprawy zasobów wody pitnej, a także stanu środowiska naturalnego.