Podmiot leczniczy, z tytułu prowadzonej działalności w zakresie usług medycznych, zwolnionej od opodatkowania podatkiem VAT, nie będzie miał prawa do zwrotu podatku naliczonego zawartego w fakturach dokumentujących nabycie przez ten podmiot towarów i usług wykorzystywanych w działalności zwolnionej z podatku VAT ani poprzez zastosowanie instytucji nadpłaty, ani poprzez systemowe rozlicznie podatku naliczonego. Wyrok WSA w Krakowie z 10 września 2014 r. sygn. I SA/Kr 907/14.

W uzasadnieniu wyroku wskazano, że regulacje obowiązujące w tym zakresie w ustawie o VAT (art. 43 ust. 1 pkt 18, 18a, 19) są zgodne z prawem wspólnotowym. W systemie podatku VAT, co do zasady, zwolnienia charakteryzują się tym, że podatnik, który z nich korzysta (z wyjątkiem przypadków precyzyjnie wskazanych w artykule 169 Dyrektywy), nie ma prawa do odliczenia lub zwrotu podatku naliczonego przy zakupie towarów i usług służących wykonywaniu czynności zwolnionych, a co za tym idzie, podobnie jak ostateczny konsument towarów lub usług, ponosi faktyczny ciężar podatku od wartości dodanej. Jest to wynikiem przyjęcia założenia, że prawo do obniżenia podatku należnego o podatek naliczony przysługuje w całości w stosunku do podatku naliczonego związanego wyłącznie ze sprzedażą opodatkowaną (art. 168 Dyrektywy). Przepis ten ustanawia jedną z najważniejszych reguł wspólnego systemu podatku VAT i jest jednym z podstawowych punktów odniesienia w doktrynie podatku od wartości dodanej.

Źródło: CBOSA