Rozporządzeniem Rady Ministrów z dnia 27 listopada 2013 roku przekształcone dotychczas istniejące: Ministerstwo Rozwoju Regionalnego oraz Ministerstwo Transportu, Budownictwa i Gospodarki Morskiej w jedno Ministerstwo Infrastruktury i Rozwoju. Ministerstwo Zdrowia dopiero w III kwartale 2014 roku dostrzegło, że zmiana ta wymaga odpowiedniego dostosowania składu Międzyresortowego Zespołu Koordynacyjnego Narodowego Programu Zdrowia.
Zmiana przepisów konstytuujących Zespół polega na wykreśleniu w katalogu podmiotów uprawnionych do delegowania członków Zespołu połączonych ministerstw, a wpisanie w to miejsce Ministerstwa Infrastruktury i Rozwoju.
Projekt zarządzenia Prezesa Rady Ministrów zmieniającego zarządzenie w sprawie powołania Międzyresortowego Zespołu Koordynacyjnego Narodowego Programu Zdrowia został skierowany do zaopiniowania przez Zespół ds. Ochrony Zdrowia i Polityki Społecznej.