Toruński Wojewódzki Szpital Zespolony dysponuje 14 specjalistycznymi oddziałami z 574 łóżkami oraz odziałem ratunkowym. Do końca przyszłego roku będzie posiadał nowoczesny blok operacyjny, oddział rehabilitacji i lądowisko dla helikopterów. Ponad 120 mln zł zostanie przeznaczone na modernizację lecznicy w ramach dwuletniego wojewódzkiego programu dużych inwestycji medycznych. Inwestycja obejmuje budowę centralnego bloku operacyjnego obejmującego 10 sal zabiegowych, lądowiska dla helikopterów, utworzenie oddziału rehabilitacji, modernizację infrastruktury technicznej i energetycznej szpitala, zakup sprzętu, zakup aparatury medycznej najnowszej generacji. Wcześniej ze środków EFRR w ramach ZPORR wykonano termomodernizację oraz wymieniono stolarkę okienną i drzwiową w trzech obiektach budowlanych szpitala.
Szpital pozyskuje środki na rozwój z różnych źródeł. Właśnie zakończyła się realizacja dwóch dużych projektów współfinansowanych ze środków Mechanizmu Finansowego Europejskiego Obszaru Gospodarczego i budżetu samorządu województwa: kompleksowego programu opieki perinatalnej i programu wysokospecjalistycznej opieki kardiologicznej. Łączyny koszt projektów to 16,9 milionów złotych. W ramach projektu „Zdrowa matka – zdrowy noworodek. Kompleksowy program opieki perinatalnej" powstała Pracownia Badań Prenatalnych umożliwiająca wczesną identyfikację wad płodu. Rozszerzyły też działalność przyszpitalna bezpłatna szkoła rodzenia oraz Poradnia Zaburzeń Laktacji. W nowoczesny sprzęt, między innymi: pulsoksymetry, inkubatory, respiratory, stanowisko do resuscytacji noworodka i lampy operacyjne wyposażone zostały wyremontowane pododdziały: ginekologiczny, izolacyjny oraz patologii ciąży. W ramach realizacji projektu przeprowadzono też serię szkoleń dla personelu. Projekt „Zwiększenie dostępności do wysokospecjalistycznej opieki kardiologicznej w Wojewódzkim Szpitalu Zespolonym w Toruniu" dotyczył utworzenia pododdziału ostrego zawału w ramach oddziału kardiologii i intensywnej opieki kardiologicznej. Wyposażono go w nowoczesną aparaturę medyczną, między innymi aparat RTG typu mobilne ramię, przenośny aparat echo serca i respiratory. Powstała także Poradnia Rehabilitacji Kardiologicznej, w której działają cztery pracownie: Diagnostyki Układu Krążenia, Prób Wysiłkowych, Treningu Ergometrycznego oraz Terapii Psychologicznej. Uruchomiono także wieloletni cykl szkoleniowy dla lekarzy.
Szpital posiada certyfikat akredytacyjny przyznawany przez Ministerstwo Zdrowia, po raz pierwszy akredytacja przyznana została na trzy lata w 2004 roku. W związku z przygotowaniami do kolejnego audytem akredytacyjnym w 2010 rok przystąpiono do projektu systemowego „Wsparcie procesu akredytacji zakładów opieki zdrowotnej" współfinansowanego przez Unię Europejską w ramach Europejskiego Funduszu Społecznego. Szpital otrzymał także Certyfikat ISO 9001: 2008 przyznany przez firmę certyfikującą TÜV SÜD, dzięki czemu w placówce funkcjonuje zintegrowany system zarządzania przez jakość.
